Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab27bQ99P58 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rab27bQ99P58 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms