Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bco2Q99NF1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bco2Q99NF1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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