Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac9Q99N13 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac9Q99N13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms