Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ms4a4dQ99N05 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ms4a4dQ99N05 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4dQ99N05 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4dQ99N05 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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