Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp26Q99MX1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp26Q99MX1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms