Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bbc3Q99ML1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bbc3Q99ML1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms