Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Epdr1Q99M71 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epdr1Q99M71 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms