Protein–RNA interactions for Protein: Q99LP6

Grpel1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel1Q99LP6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grpel1Q99LP6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grpel1Q99LP6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grpel1Q99LP6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms