Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Rcbtb2Q99LJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Rcbtb2Q99LJ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms