Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RtcbQ99LF4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RtcbQ99LF4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RtcbQ99LF4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms