Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nmd3Q99L48 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nmd3Q99L48 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms