Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dnajb11Q99KV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms