Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PpifQ99KR7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PpifQ99KR7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms