Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubxn2aQ99KJ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn2aQ99KJ0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn2aQ99KJ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms