Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Emc3Q99KI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Emc3Q99KI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms