Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec3Q99J72 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec3Q99J72 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms