Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smim11aQ99J19 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smim11aQ99J19 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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