Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctu1Q99J10 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctu1Q99J10 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctu1Q99J10 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms