Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATG4CQ96DT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG4CQ96DT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.6 ms