Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfdQ925I7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfdQ925I7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfdQ925I7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms