Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csmd1Q923L3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csmd1Q923L3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csmd1Q923L3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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