Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b5Q923D4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sf3b5Q923D4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms