Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Traf7Q922B6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Traf7Q922B6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms