Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx18Q91ZR2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx18Q91ZR2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms