Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcdhb12Q91Y07 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcdhb12Q91Y07 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms