Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trub2Q91WG3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trub2Q91WG3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trub2Q91WG3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms