Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csde1Q91W50 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Csde1Q91W50 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csde1Q91W50 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms