Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itm2cQ91VK4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2cQ91VK4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms