Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NifkQ91VE6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NifkQ91VE6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms