Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rdh10Q8VCH7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Rdh10Q8VCH7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Rdh10Q8VCH7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rdh10Q8VCH7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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