Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q8VCE4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8VCE4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms