Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnajc28Q8VCE1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajc28Q8VCE1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajc28Q8VCE1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms