Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc9Q8VC31 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc9Q8VC31 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc9Q8VC31 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms