Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc2Q8VBV3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc2Q8VBV3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms