Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CipcQ8R0W1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CipcQ8R0W1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms