Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3V1

Spata4, Spermatogenesis-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata4Q8K3V1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spata4Q8K3V1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spata4Q8K3V1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spata4Q8K3V1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms