Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
OptnQ8K3K8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
OptnQ8K3K8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
OptnQ8K3K8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms