Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs8Q8K3J1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufs8Q8K3J1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms