Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ssh3Q8K330 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ssh3Q8K330 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ssh3Q8K330 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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