Protein–RNA interactions for Protein: Q8K327

Champ1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Champ1Q8K327 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Champ1Q8K327 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Champ1Q8K327 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms