Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccm2Q8K2Y9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccm2Q8K2Y9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms