Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmc2Q8K199 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmc2Q8K199 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms