Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ9

Eif3b, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3bQ8JZQ9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3bQ8JZQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3bQ8JZQ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3bQ8JZQ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Eif3bQ8JZQ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3bQ8JZQ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3bQ8JZQ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif3bQ8JZQ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms