Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2-Q4Q8HWB2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Q4Q8HWB2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2-Q4Q8HWB2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms