Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ago3Q8CJF9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ago3Q8CJF9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ago3Q8CJF9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms