Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip10Q8CJ53 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms