Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc34Q8CFI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdc34Q8CFI2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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