Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Gm9955Q8CEJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Gm9955Q8CEJ8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm9955Q8CEJ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm9955Q8CEJ8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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