Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc17Q8CE13 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc17Q8CE13 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms