Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Lrrc9Q8CDN9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc9Q8CDN9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms